美境自然最高的权力机构为会员大会，会员大会选举产生理事会和监事会，理事会负责筹备召开会员大会、向会员大会报告工作和财务状况、领导开展本机构的工作、制定本机构内部管理制度等事项。理事会下属设秘书处，各部门开展工作均向秘书处汇报。

目前美境自然的人员组成如下：

理事会成员：理事会会长黎晓亚、副会长张颖溢、副会长林森、秘书长陶镜如

监事会成员：监事会主任王双玲、监事会副主任曾伟、监事孙仁杰

秘书处工作人员：

1）运营部门：刘陈男、赵红旭、罗利

2）科学保护部门：林吴颖、肖晓波、赵心忆、黎晓亚、耿艳菁

3）行政财务部门：陶镜如、农彩珍

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美境的顾问是聘请的行业内有声望的保护人士，任期三年，目前共有7位。

顾问将协助理事会和秘书处策划战略计划和日常的运用。

美境顾问简介如下：